O Projeto Iniciação Científica no Ensino Médio visa despertar a vocação científica e fortalecer processos que disseminem conhecimentos científicos entre os jovens a fim de desenvolver atitudes, habilidades e valores necessários à educação científica, tecnológica e pesquisa da biodiversidade. Dentre suas atribuições, podem ser destacados: o estímulo à pesquisa junto aos estudantes do Ensino Médio, objetivando a formação integral do discente, conduzida pela reflexão e criatividade; a introdução do jovem no domínio do método científico e no aprendizado de técnicas específicas de investigação; a criação e participação dos educandos em eventos científicos e extensionistas.

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O Projeto Iniciação Científica no Ensino Médio é desenvolvido através de uma parceria institucional com o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) e com a Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ). Dessa forma, os educandos que participam deste projeto do CRS também integram o Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Cientifica (PIBIC-CNPq) e o Programa Jovens Talentos (JT-FAPERJ).